A biokomposzt szerves forrásból származó komposzt, ami biztonságossá teszi a biokertészetben való felhasználást. Az emberek saját maguk is készíthetnek szerves komposztot, de kereskedelmi forgalomban is előállítható. A kertészeti központok nagy választékban kínálnak szerves komposztot. A kereskedelmi forgalomban kapható szerves komposzt általában drágább, mint a hagyományos komposzt, mivel több munkát igényel, beleértve a részletekre való odafigyelést annak biztosítására, hogy a komposztban lévő összes anyag valóban szerves anyag legyen.

A "szerves trágya" meghatározása mindenki számára eltérő lehet, de vannak bizonyos szabályok és előírások a szerves trágya és komposzt előállítására vonatkozóan. A biogazdálkodás általában nem használ vegyszereket vagy anyagokat a kártevők elleni védekezéshez vagy a talaj trágyázásához. A gazdaság a természetes műtrágyák, a kártevők elleni védekezés és más hagyományosabb gazdálkodási módszerek használatát részesíti előnyben. A tanúsítás érdekében a szerves komposztokat és műtrágyákat bizonyos ellenőrző szervek ellenőrzik, amelyek a bio-előírásokat alkalmazzák. Az ilyen termékek előállításához használt anyagoknak is biominősítettnek kell lenniük a keresztszennyeződés elkerülése érdekében.

A szerves komposzt esetében a nyersanyagot szerves forrásból kell beszerezni. A biogazdaságokban gyakran keletkezik hulladék, amelyből később komposztot állítanak elő. A komposzt tartalmazhat dísznövénykertekből származó dugványokat, valamint bioéttermek hulladékát is. Az olyan takarmánykiegészítők, mint a szalma és a kávézacc, szintén bioforrásokból származnak.
A normál komposzttal ellentétben a biokomposzt nem tartalmazhat vegyszermaradványokat és más olyan anyagokat, amelyek a törvény szerint nem minősülnek "szerves" anyagnak. A biokertészek számára a szerves komposzt használata elengedhetetlen, hogy elkerüljék az olyan anyagok bevitelét, amelyek veszélyeztethetik a kert szerves állapotát. Ha például a kertész hagyományos komposztot használ, és permetezi a gyümölcsfákat a biokertben, a gyümölcsök kezelésére használt permetszerek beszennyezhetik a talajt, és a kert alkalmatlanná válhat a biotermesztésre.

Az ökológiai státuszt nagyon nehéz megszerezni, mivel szigorú eljárásokkal kell bizonyítani, hogy a termékek, a komposzt és a műtrágya ökológiai eredetűek. A nagyszámú biogazdasággal rendelkező közösségekben a környező gazdaságokból származó hulladékot átvevő szövetkezetek felhasználhatják azt szerves komposzt előállítására. Kereskedelmi szervezetek is gyűjthetnek komposztálásra szánt anyagot, hogy szerves komposztot állítsanak elő olyan kertészek és gazdaságok számára, akik nem akarnak maguk komposztot előállítani.